Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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CHST4Q8NCG5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CHST4Q8NCG5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CHST4Q8NCG5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHST4Q8NCG5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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