Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC63Q8NA47 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms