Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM2Q8N271 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms