Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX29P2Q8IUI4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms