Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKAP1Q86WV1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms