Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT27Q7Z3Y8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms