Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL4Q6ZR62 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms