Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms