Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms