Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSSK4Q6SA08 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms