Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED9Q6R2W3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms