Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LETMD1Q6P1Q0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms