Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HMBOX1Q6NT76 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMBOX1Q6NT76 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms