Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GARNL3Q5VVW2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms