Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CC2D1BQ5T0F9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms