Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF8

HSP90AB2P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB2PQ58FF8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB2PQ58FF8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB2PQ58FF8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms