Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAN3Q58A45 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAN3Q58A45 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms