Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms