Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKDCCQ504Y2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms