Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms