Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBPF8Q3BBV2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms