Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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