Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KNOP1Q1ED39 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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