Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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RTL8BQ17RB0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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