Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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