Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP6Q16828 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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