Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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