Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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