Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACKR1Q16570 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms