Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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