Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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