Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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