Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK4Q16099 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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