Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms