Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms