Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-1Q15270 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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