Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms