Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms