Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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COL19A1Q14993 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL19A1Q14993 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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