Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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