Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IHHQ14623 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IHHQ14623 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IHHQ14623 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
IHHQ14623 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms