Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms