Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SQLEQ14534 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms