Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TRIM25Q14258 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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