Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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COL4A6Q14031 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL4A6Q14031 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL4A6Q14031 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL4A6Q14031 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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