Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX3Q13761 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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