Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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