Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2BQ13554 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms