Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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