Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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